《地表水环境质量标准》（GB3838-2002）按照功能高低将水体划分为五类：
Ⅰ类主要适用于源头水、国家自然保护区；
Ⅱ类主要适用于集中式生活饮用水地表水源地一级保护区、珍稀水生生物栖息地、鱼虾类产卵场、幼鱼的索饵场等；
Ⅲ类主要适用于集中式生活饮用水地表水源地二级保护区、鱼虾类越冬场、洄游通道、水产养殖区等渔业水域及游泳区；
Ⅳ类主要适用于一般工业用水区及人体非直接接触的娱乐用水区；
Ⅴ类主要适用于农业用水及一般景观要求水域。
《海洋水质标准》（GB3097）按照海域的不同使用功能和保护目的，将海水水质分为四类：
第一类适用于海洋渔业水域，海上自然保护区和珍稀濒危海洋生物保护区；
第二类适用于水产养殖区，海水浴场，人体直接接触海水的海上运动或娱乐区，以及与人类食用直接有关的工业用水区；
第三类适用于一般工业用水，滨海风景区；
第四类适用于适用于海洋港口水域，海洋开发作业区。

排入《地表水环境质量标准》 Ⅲ类（规定的保护区和游泳区除外）和《海洋水质标准》中二类海域的污水执行一级标准。排入Ⅳ、 Ⅴ类水域和三类海域的污水，执行二级标准。排入设置二级污水处理厂的城镇排水系统的污水，执行三级标准。
GB3838中Ⅰ、Ⅱ类水域和Ⅲ类水域中划定的保护区，GB 3097中一类海域，禁止新建排污口，现有的排污口应按照水体功能要求，实施污染物总量控制，保证受纳水体水质符合规定用途的水质标准。

将排放的污染物按照性质和控制方法可分为两类
第一类污染物，不分行业和污水排放方式，也不分受纳水体的功能类型，一律在车间或车间处理设施排放口采样，其允许排放浓度达到本标准要求（共13项）；
第二类污染物，在排污单位排放口采用，其允许排放浓度必须达到本标准要求